Projekt badawczy KBN zamawiany, Nr 010/T12/1998 Temat: Człowiek i środowisko wobec procesu restrukturyzacji górnictwa węgla kamiennego. Termin i miejsce realizacji prac: Główny Instytut Górnictwa, PAN Instytut Gospodarki Surowcami Mineralnymi, AGH Wydział Górniczy, Państwowa Agencja Restrukturyzacji Górnictwa Węgla Kamiennego S.A, 1998-2000. Kierownik zadania realizowanego w AGH: Barbara Jabłońska-Firek J.T.Duda -wkład merytoryczny: wykonawca odpowiedzialny za dobór narzędzi formalnych analizy kosztów likwidacji kopalń węgla kamiennego w Polsce w latach 1991-2000, uczestniczący w opracowaniu koncepcji oceny makroekonomicznych efektów likwidacji.
Projekt badawczy KBN, Nr 8T11 A 00918 Temat: Algorytmy i programy sterowania nadrzędnego ciągłymi procesami przemysłowymi. Miejsce i okres realizacji: AGH, Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Elektroniki i Informatyki, Katedra Automatyki, Kraków 1999- 2002 Kierownik: Jan T.Duda J.T.Duda -wkład merytoryczny: koordynacja całości badań, realizacja zadania dotyczącego uogólnień algorytmów regulacji predykcyjnej pod katem ich zastosowania do sterowania nadrzędnego, nadzór nad realizacją oprogramowania do sterowania nadrzędnego.
Projekt badawczy KBN, Nr 9T12A04819. Temat: Pochłanianie par i gazów w węglach kamiennych w świetle modelu adsorpcyjno – absorpcyjnego. Miejsce i okres realizacji: AGH, Wydział Paliw i Energii, Kraków 2000 – 2002 Kierownik: Janina Milewska-Duda. J.T.Duda -wkład merytoryczny: główny wykonawca – udział w uogólnieniu i rozbudowie modeli matematycznych procesu adsorpcji, analiza formalna właściwości tych modeli pod kątem ich wykorzystania do badania struktury adsorbentów, prowadzenie analiz numeryczych.
Badania własne Wydziału Zarządzania AGH w okresie 2005- 2007: Temat: Rozwijanie metod komputerowego przetwarzania danych w zarządzaniu i technice. Kierownik Jan T.Duda
Działalność statutowa Wydziału Zarządzania AGH w okresie 2007- 2009: Temat ogólny: Marketingowe aspekty rozwoju procesów obsługowych przedsiębiorstwa. Zadanie 1 (kierownik Jan T.Duda): Rozwijanie metod algorytmicznego przetwarzania danych w zarządzaniu przedsiębiorstwem
Grant KBN nr 2826/H03/2007/32, Adaptacyjne algorytmy detekcji zdarzeń w szeregach czasowych. WZ AGH, KIS Kierownik J.T.Duda. Okresd realizacji 14.05.2007- 13.11.2008
Grant KBN nr 4059/B/T02/2008/34, Wielokryterialna optymalizacji portfelowa metodami programowania całkowitoliczbowego mieszanego. WZ AGH, KIS Kierownik J.T.Duda. Okresd realizacji 14.05.2008- 31.12.2011
Interdyscyplinarne badania z zakresu modelowania cyfrowego, elektroenergetyki i informatyki – źródłem innowacji systemu informatycznego dla dystrybutorów energii/Apator Rector Sp. z o.o., Zielona Góra. WZ AGH, KIS Kierownik J.T.Duda. Okresd realizacji 28.07.2010- 30.09.2011
Pojekt badawczy NCBiR „Zintegrowany system sterowania produkcją INSTEPRO (2009-2011)” – Program Operacyjny – Innowacyjna Gospodarka 2007-2013, priorytet 1, działania 1.3 POIG poddziałanie 1.3.1 Badanie i rozwój nowoczesnych technologii, nr UDA-POIG.01.03.01-12-171/08/00. Jan T.Duda – główny wykonawca odpowiedzialny za projekt i implementację podsystemu komunikacji międzyprocesowej w czasie rzeczywistym; projekt i implementację podsystemu zarządzania usługami w czasie rzeczywistym; projekt i implementację bazy danych czasu rzeczywistego dedykowanej dla zadań sterowania; projekt i implementację algorytmu wielowymiarowej regulacji w czasie rzeczywistym; projekt i implementację interfejsów operatorskich
Badania Statutowe AGH 11/11.200.232 „Nowoczesne metody numeryczne i techniki informatyczne w zarządzaniu” Jan T. Duda – kierownik badań i kierownik zesopołu badawczego w zakresie analiz szeregów czasowych, w szczególności: opracowanie nowych algorytmów wykrywania zdarzeń w szeregach czasowych opracowanie nowych metod redukcji ryzyka transakcji giełdowych (analizy portfelowe i płatności koszykowe)
Projekt NCN „Tworzenie i stosowanie prawa w ujęciu teorii komunikacji i zarządzania wiedzą”. Nr projektu: NN110133940 Źródła finansowania: NCN . Wysokość finansowania: 141 200,00 PLN. Uniwersytet Jagielloński, 2011-2013. Jan T.Duda – wykonawca (konsultant) w zakresie problematyki przetwarzania danych: zastosowanie nowoczesnych technologii ICT do budowania hipertekstualnego systemu aktów prawa, wykorzystanie formatu XML w tekstach prawnych, ocena neutralności technologicznej różnych rozwiązań ICT.